Acta Univ. Agric. Silvic. Mendelianae Brun. 2008, 56(2), 57-60 | DOI: 10.11118/actaun200856020057
Genetická struktúra deviatich plemien koní
- 1 98011 Ozdany 505, Slovenská republika
Plemená boli anlyzované vybranými 17 mikrosatelitnými markermi (AHT4, AHT5, ASB2, HMS3, HMS6, HMS7, HTG4, HTG10, VHL20, HTG6, HMS2, HTG7, ASB17, ASB23, CA425, HMS1, LEX3). Genotypové dáta 17 mikrosatelitných markerov sa získali pomocou DNA analýzy biologických vzoriek vybraných jedincov. Panel testovaných mikrosatelitných markerov je doporučený organizáciou FAO pre štúdium genetickej diverzity, organizáciou ISAG pre overovanie paternity.
Na základe genetickej diverzity sa zaoberáme otázkami oddelenia populácie Českého teplokrvníka, Slovenského teplokrvníka a Slovenského teplokrvníka chovaného na Slovensku, a vytvorenia geneticky rozdielných skupín jedincov a či je možné na základe týchto údajov vybrané plemená dostatočne charakterizovať a vymedziť.
Aj napriek skutočnosti, že plemená Český a Slovenský teplokrvník majú oddelené plemenné knihy, stanovené genetické vzdialenosti, výsledky klasifikačných i zhlukovacích metód ukazujú, že plemená nie je možné na základe nami sledovaných mikrosatelitných markerov uspokojivo vymedziť. V rámci skupiny Český teplokrvník neboli zahrnuté jedince plemien Moravský teplokrvník a kôn Kinský, ktoré v minulosti boli súčasťou plemena Český teplokrvník.
Pri analýze genetickej charakteristiky plemena Hucul sa zistila vysoká miera genetickej variability, napriek tomu, že stav tohto plemena v rámci ČR i celosvetovo varovný, je zrejmé, že i pri zostávajúcom stave jedincov je možné zachovať genetickú variabilitu a odlišnosť v porovnaní s ostatnými plemenami koní, čo sa chovateľom doposiaľ darí. Sledovanie genetickej diverzity plemena môže výrazne prispieť k jeho zachovaniu.
Algoritmy pre úlohy klasifikácie, zhlukovania a faktorovú analýzu použité v práci sa ukázali vhodné pre štúdium genetickej diverzity, štruktúry populácií na rôznych úrovniach a rozlíšenie plemien.
mikrosatelity, plemena koní, genetická diverzita
Genetic structure of nine horse populations
In the present study was estimate the genetic diversity and relationships among nine horses breeds in Czech and Slovak Republic.
In conclusion, the main objective of study was to show the level of genetic distance among the horse breeds with different history of breeding of each country. Furthermore, it should be clarified whether these populations and subpopulations are distinct enough from each other to justify defining separate breeds. This research concerns the variability of microsatellite markers in genotypes of horse.
We compared the genetic diversity and distance among nine horse breeds Czech and Slovak Warmblood both of Czech origin, Slovak Warmblood of Slovak origin, Hucul, Hafling, Furioso, Noriker, Silesian Noriker and Bohemian-Moravian Belgian Horse.
In total, 932 animals were genotyped for 17 microsatellites markers (AHT4, AHT5, ASB2, HMS3, HMS6, HMS7, HTG4, HTG10, VHL20, HTG6, HMS2, HTG7, ASB17, ASB23, CA425, HMS1, LEX3) recommended by the International Society of Animal Genetics.
In the different population size, the allele frequencies, observed and expected heterozygosity, test for deviations from Hardy-Weinberg equilibrium and Polymorphism information content have been calculated for each breed. We analyzed genetic distance and diversity among them on the base of the dataset of highly polymorphic set of microsatellites representing all autozomes using set of PowerMarker v3.25 analysis tools and Structure 2.2. programme for results comparison.
Keywords: microsatellite, horse breeds, genetic diversity
Grants and funding:
This work was supported by grant FRVS FR270251.
Received: December 13, 2007; Published: November 14, 2014 Show citation
| ACS | AIP | APA | ASA | Harvard | Chicago | IEEE | ISO690 | MLA | NLM | Turabian | Vancouver |
References
- BJORNSTAD, G., and ROED, K. H., 2002: Evaluation of factors affecting individual assignement precision using microsatellite data from horse breeds and simulated breed crosses. Animal Genetics 33: 264. DOI: 10.1046/j.1365-2052.2002.00868.x
Go to original source... - CAÑON, J., CHECA, M. L, CARLEOS, C., VEGA-PLA, L.,VALLEJO, M. and DUNNER, S., 2000: The genetic structure of Spanish Celtic horse breeds inferred from microsatellite data. Animal Genetics 31: 39. DOI: 10.1046/j.1365-2052.2000.00591.x Go to original source...
- CUNNINGHAM, E. P., DOOLEY, J. J., SPLAN R. K. and BRADLEY, D. G., 2001: Microsatellite diversity, pedigree relatedness and the contributions of founder lineages to thoroughbred horses. Animal Genetics 32: 360. DOI: 10.1046/j.1365-2052.2001.00785.x Go to original source...
- GLOWATZKI-MULLIS, M. L., MUNTWYLER, J., PFISTER, W., MARTI, E., RIEDER, S., PONCET, P. A. and GAILLARD, C.,2006: Genetic diversity among horse populations with a special focus on the Franches-Montagnes breed. Animal Genetics 37: 33. DOI: 10.1111/j.1365-2052.2005.01376.x Go to original source...
This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License (CC BY NC ND 4.0), which permits non-comercial use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original publication is properly cited. No use, distribution or reproduction is permitted which does not comply with these terms.